生豆浆中含有丰富的蛋白质、脂肪和糖类，是微生物生长的理想条件。所以，豆浆必须煮熟烧透才能将微生物杀死。另外，豆浆中含有一种叫做皂苷的毒素，因为它的水溶液在摇振后能产生肥皂样泡沫，因此名字里有个“皂”字。
通常，锅内豆浆出现泡沫沸腾时，温度只有80℃，这时是豆浆出现“假沸”现象，此时应减火力，用匙充分搅拌，以免豆浆溢出，再继续煮沸5分钟~10分钟，直至泡沫完全消失，这样才能使有害物质被彻底分解。另外，营养学家研究发现，豆浆经煮沸可提高其中大豆蛋白的营养价值。
没煮熟的豆浆中含有皂角素、胰蛋白酶抑制剂等物质，这些物质比较耐热，如果豆浆未煮熟进入胃肠道，会刺激人体的胃肠黏膜，使人出现一些中毒反应，如恶心、腹痛、呕吐、腹泻、头晕等中毒症状，严重的可引起脱水和电解质紊乱，若抢救不及时，会危及性命。